A l’âge de 33 ans, il part s’installer en Allemagne à Munich de 1979 à 1985 en faisant des aller retours à Londres. Il est d’abord séduit par un appartement près de Sebastians Platz. Il y restera 3 ans.
Les impôts au Royaume Unis étant exorbitant, Freddie Mercury a préféré s'expatrier en Allemagne, ainsi que de se protéger de sa notoriété, la presse et les fans le traquaient sans relâche.
Il disait que l'Allemagne était son paradis et qu'il pouvait sortir dans la rue et manger des saucisses sans que personne ne lui dise rien.
À la fin des années soixante-dix, Freddie, qui a déjà acquis un pied-à-terre à New York (et, bien sûr, à Londres), il découvre Munich avec ravissement. Il restera trois ans dans la ville bavaroise, alors célèbre pour ses techniques d’enregistrement et sa musique disco qui se répandait dans le monde entier. Il a pensé à écrire des chansons disco mais les autres membres du groupe n'ont pas adhéré.
Tout est autorisé personne ne juge le comportement des autres. Les gays se retrouvent les nuits dans les bars, et Freddie est subjugué par ces espaces de liberté.
Brian May témoigne qu'ils ont tous vécus une vie différente, ils étaient fascinés par le Sugar Shack, une discothèque Rock avec un sound system incroyable. Freddie se consumait à petit feu entre les répétitions et la fête toute la nuit. Freddie a avoué à Mack Reinhold qu'il arrêterait peut être d'être gay car il aimait les femmes.
Freddie se rendait souvent chez Mack et se rapprochait beaucoup de sa femme Ingrid et de ses enfants. Il était séduit par le fait de fonder une famille. Mais Mack savait que Freddie vivait de frénésie et de sexe et il ne le voyait pas avec une famille.
Mack raconte que Freddie discutait beaucoup avec son fils Félix et il lui racontait son enfance loin de ses parents.
Il y réside avec ses amis fidèles Joe Fannelli (restaurateur)et Peter Freestone son secrétaire (affublé d’un prénom féminin, Phoebe), secrétaires que l’on pourra considérer comme ses « hommes de confiance » et ses « hommes de compagnie » ou, plus prosaïquement, ses employés de maison. (Qui seront tous deux couchés sur le testament de Freddie, se voyant dotés, chacun, d’une somme de 500 000 livres). Peter Freestone a confirmé qu'il n'avait eu de relation avec Freddie autre que son ami et employé, aucune relation sexuelle entre eux deux.
A cette période, il vit une grande histoire d’amour avec l’actrice autrichienne Barbara Valentin. Il dort parfois chez elle, rue « Stollberg Strasse ». Freddie avait acheté un appartement sur « Hans Sachs Strasse » pour y vivre avec Barbara mais ils se sont séparés et ne s’y sont donc jamais installés. Après 3 ans, Freddie Mercury retourne vivre au Royaume-Uni.
Deux Hommes et une femme
Toujours à Munich, Freddie achète un appartement qu’il partage avec Barbara Valentin. Ils se retrouvaient souvent à trois dans le même lit : Barbara, Freddie, et sa conquête masculine de la soirée. Le choix d’une telle ville repose sur l’esprit de liberté qui y règne pour la communauté homosexuelle ; il y avait notamment un quartier gay où tout était permis. Freddie Mercury tomba amoureux de Winnie Kichberger, un restaurateur.
Freddie a rompu toute relation avec les deux amants, ayant retrouvé Jim Hutton, coiffeur qu'il avait rencontré dans un bar, celui ci est venu le chercher en Allemagne. Freddie a malgré tout gardé des contacts amicaux avec Barbara Valentin.
Selon Peter Freestone, ils avaient beaucoup de points communs, et Freddie était touché par la sincérité de Barbara. Mais lorsque des rumeurs sur leur aventure et sur le fait que le couple allait se marier sont apparues dans la presse, Freddie en a conclu que Barbara voulait attirer l’attention sur elle et était à l’origine de ces fuites. Freddie fut tellement bouleversé par cet épisode qu’il n’a quasiment plus jamais communiqué avec elle durant la dernière partie de sa vie.